В табл.3 «Информация о внутривузовском совместительстве руководителя» в столбце «Срок трудового договора» ставить сроки начала и окончания ТД или только окончания,так же в табл.7 «Педагогическая деятельность руководителя» в какую строку надо ставить объем нагрузки в учебных часах?

Указывать необходимо срок договора, то есть и дату начала, и дату окончания.
Таблицей 7 предусмотрено указание нагрузки в учебных часах (указано в наименовании графы).