В сборе информации по выплатам руководителю районный коэффициент 30% писать в какой столбец? Внутреннее совместительство у руководителя отсутствует. Оставляем таблицы пустыми или ставим, например, прочерки или нули?

Районный коэффициент указываем как и все компенсационные выплаты в отдельной графе. В целях обеспечения сходимости данных между таблицами в случае, если руководителю по основной должности выплачивались премии по приказам вуза, компенсационные выплаты на них (районные коэффициенты и северные надбавки) целесообразно отразить в сумме премии, иначе не будут сходиться остальные таблицы.
Если нет внутреннего совместительства или каких-либо видов выплат, таблицы не заполняются.