В нашем калькуляторе публикаций не рассчитаны коэффициенты участия организации в верифицированных статьях. Только в графе ВАК стоит 1. Можно ли самим ввести коэффициенты =1? Только тогда калькулятор рассчитывает баллы.

Нет самим ввести коэффициенты нельзя. Если у Вас там стоят нули, значит у Вас не было верифицированных публикаций за осенний период по данным квартилям.