Руководителем лаборатории должен быть ведущий ученый из числа российских или зарубежных ученых. Какие есть ограничения? (он должен быть принят в штат на время выполнения проекта по трудовому договору или допустим гражданско-правовой договор? Или возможно определенное время пребывания на территории РФ?)

Ограничения не установлены, руководитель несет ответственность за качество выполнения проекта. Или штат или гражданско-правовой договор.