Остался остаток на 01.01.2020г. по субсидии на иные цели. Сейчас этот остаток в статусе «неразрешенный к использованию». Нужно ли его отображать в ПФХД на начало года?

Да нужно отражать. Если Вы планируете направить их на те же цели, то можете отразить их по соответствующим кодам выплат.