Если студент, обучается на внебюджетной основе, и ему выплачивается материальная помощь. По какому КОСГУ и КВР отразить данную выплату? И за счет каких источников возможно выплатить, ведь в перечень нормативных затрат на подготовку студента не заложены виды мат.поддержки?

Если студент обучается на внебюджетной основе, то ему следует выплачивать материальную поддержку из внебюджетных средств.
Коды КОСГУ указаны в Приказе Минфина России от 06.06.2019 N 85н (ред. от 29.11.2019) «О Порядке формирования и применения кодов бюджетной классификации Российской
Федерации, их структуре и принципах назначения».